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Les particules virales, ou virions, sont composées d'un acide nucléique, ARN ou ADN (le génome) enveloppé d'une coque protéique, la capside. Certains virus comportent aussi une membrane externe lipoprotéique dérivée des membranes de l'hôte. C'est la capside, composée en général, d'une seule protéine, qui détermine la forme générale du virion. Les protéines de capside sont disposées selon deux types d'arrangements :
Sources : fr.wikipedia.org
symétrie hélicoïdale, qui donne des virions en bâtonnets (bacilliformes) rigides ou flexueux, symétrie icosaédrique qui donne en général des virions de forme parasphérique. L'assemblage de particules virales se fait spontanément. Plus de 50 % des virus végétaux connus sont en forme de bâtonnet (flexueux ou rigides). La longueur de la particule dépend normalement du génome, mais elle est généralement comprise entre 300 et 500 nm avec un diamètre de 15 à 20 nm. Des sous-unités protéiques peuvent être placées à la circonférence d'un cercle pour former un disque. En présence du génome viral, les disques sont empilés, puis un tube est créé autour de l'acide nucléique génomique La deuxième structure la plus courante parmi les particules de virus végétaux sont les particules isométriques. Elles ont un diamètre de 25 à 50 nm. Dans les cas où il n'y a qu'une seule protéine d'enveloppe, la structure de base se compose de 60 sous-unités T, où T est un entier. Certains virus peuvent avoir 2 protéines d'enveloppe qui s'associent pour former une particule icosaédrique. Chez trois genres de Geminiviridae, les particules se composent de deux particules isométriques jumelles (comme collées ensemble). Un très petit nombre de virus végétaux ont, en plus de leurs protéines d'enveloppe, une enveloppe lipoprotéique.
Sources : fr.wikipedia.org
la nature du matériel génétique: ADN ou ARN, mono- ou bicaténaire (un brin ou deux) ; le niveau d’homologie (ressemblance issue d’un ancêtre commun) des gènes. Pour ce faire, le matériel génétique de chaque virus est séquencé. Les successions des bases azotées des différents virus sont comparées, et les virus dont les séquences sont les plus proches sont regroupés dans un même taxon. Les genres (par exemple les Caulimovirus), puis les familles (par exemple les Caulimoviridae), sont définis par leur degré d'homologie. La plupart des genres de phytovirus ont été affectés à des familles, il subsiste cependant quatre genres isolés (incertae sedis) : Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus et Virtovirus. Ces genres ont été créés en 2016 pour accueillir des virus-satellites lorsque l'ICTV a décidé d'abandonner la distinction entre les virus-satellites et les autres virus.
Sources : fr.wikipedia.org
Dans une moindre mesure, la forme des particules virales est utilisée comme critère, notamment pour le groupe des virus à ARN monocaténaire messager. Cette famille est subdivisée en virus isométriques, particules hélicoïdales, en bâtonnet ou flexueuses.
Sources : fr.wikipedia.org
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La pureté et l'analyse (HPLC, spectrométrie de masse), une reconstitution correcte et un stockage adapté sont déterminants.%!(EXTRA string=Sr9009)
Tous les mécanismes ne sont pas démontrés et une étude isolée ne fait pas une preuve globale. Les questions ouvertes sont signalées comme telles.%!(EXTRA string=Sr9009)